Η υπόθεση της μαφίας των Χανίων έχει ανοίξει ένα πολύπλοκο πλέγμα ερωτημάτων που αγγίζει την τοπική κοινωνία, την πολιτική ζωή αλλά και τον εκκλησιαστικό χώρο. Δύο συνομιλίες που καταγράφηκαν από τον «κοριό» της ΕΛ.ΑΣ. και περιλαμβάνονται στη δικογραφία αναφέρονται ευθέως στο όνομα του Αρχιμανδρίτη Μελχισεδέκ, με τον φερόμενο ως εγκέφαλο της οργάνωσης να ζητά, όπως προκύπτει από τη δικογραφία, ρουσφέτι από τον Πάνο Καμμένο προκειμένου να εκλεγεί στον μητροπολιτικό θρόνο
