Ανοικτή πληγή για την Εκκλησία της Κύπρου είναι η υπόθεση του Παγκράτιου Μερακλή. Φέτος συμπληρώνονται 27 χρόνια από το εκκλησιαστικό ζήτημα που διαδραματίστηκε στα μέσα της δεκαετίας του ’90. Το 1998, η Ιερά Σύνοδος αποφάσισε να θέσει σε απ’ αόριστον αργία τον Αρχιμανδρίτη Παγκράτιο, με την αιτιολογία ότι ήταν φορέας του AIDS. Κατά καιρούς είχε εγερθεί το θέμα της αποκατάστασής του, αλλά το έδαφος κρίθηκε πιο πρόσφορο μετά την εκλογή
